Histoire :
La première mention du nom de La Chapelle-Gonaguet remonte à la fin du XIIème siècle : avec en 1199, Capela d'Agonaguet qui signifie « Chapelle du Petit Agonac », puis Eculesia d'Agonaguet et Gonaguetam en 1380.
Au XVIIIème siècle, elle est identifiée comme La Chapelle Gounaguet sur la carte de Cassini représentant la France entre 1756 et 1789.
En 1809, la partie Merlande de l'ancienne commune de Merlande-et-Andrivaux fusionne avec La Chapelle-Gonaguet.
Rattachements administratifs :
La commune de La Chapelle-Gonaguet a été rattachée, dès 1790, au canton de Lisle qui dépendait du district de Perigueux jusqu'en 1795, date de suppression des districts. En 1801, la commune est alors rattachée au canton de Grignols dépendant de l'arrondissement de Périgueux. En 1829, à la suite du transfert de son chef-lieu, le canton prend le nom de canton de Saint-Astier.
Intercommunalité :
Le 27 décembre 2002, la commune adhère à la communauté d'agglomération périgourdine. Celle-ci disparait le 31 décembre 2013, remplacée au 1er janvier 2014 par une nouvelle intercommunalité élargie : Le Grand Périgueux.
Toponymie :
En occitan, la commune porte le nom de La Chapela de Gonaguet.
